Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSKSQ9UJT2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TSKSQ9UJT2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSKSQ9UJT2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSKSQ9UJT2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSKSQ9UJT2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms