Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT7Q9UIV1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT7Q9UIV1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms