Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3BQ9UH17 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms