Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFIP11Q9UBB9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFIP11Q9UBB9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms