Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRP2BPQ9P2M1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRP2BPQ9P2M1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRP2BPQ9P2M1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRP2BPQ9P2M1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRP2BPQ9P2M1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP2BPQ9P2M1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRP2BPQ9P2M1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms