Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHPF2Q9P2E5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms