Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN3Q9P232 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN3Q9P232 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms