Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0X4

CACNA1I, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1I, humanhuman

Predictions only

Length 2,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1IQ9P0X4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1IQ9P0X4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA1IQ9P0X4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1IQ9P0X4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms