Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2AIPQ9NXV6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms