Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYARQ9NX58 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYARQ9NX58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LYARQ9NX58 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYARQ9NX58 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LYARQ9NX58 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LYARQ9NX58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYARQ9NX58 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYARQ9NX58 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYARQ9NX58 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYARQ9NX58 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYARQ9NX58 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LYARQ9NX58 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LYARQ9NX58 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYARQ9NX58 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYARQ9NX58 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LYARQ9NX58 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LYARQ9NX58 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYARQ9NX58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYARQ9NX58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms