Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB20Q9NX57 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms