Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLE1Q9NVX2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLE1Q9NVX2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLE1Q9NVX2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms