Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIC8BQ9NVN3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIC8BQ9NVN3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms