Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTLC3Q9NUV7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPTLC3Q9NUV7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms