Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP8A2Q9NTI2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8A2Q9NTI2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP8A2Q9NTI2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms