Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FARSBQ9NSD9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms