Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC6A13Q9NSD5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A13Q9NSD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms