Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6BQ9NRW1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6BQ9NRW1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms