Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF3Q9NR23 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF3Q9NR23 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms