Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM5Q9NQX1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM5Q9NQX1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM5Q9NQX1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM5Q9NQX1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM5Q9NQX1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM5Q9NQX1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM5Q9NQX1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM5Q9NQX1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM5Q9NQX1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM5Q9NQX1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRDM5Q9NQX1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM5Q9NQX1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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