Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM7Q9NQW5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM7Q9NQW5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms