Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD93Q9NPY3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD93Q9NPY3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms