Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA4Q9HCM2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA4Q9HCM2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms