Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK5

AGO4, Protein argonaute-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGO4Q9HCK5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGO4Q9HCK5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGO4Q9HCK5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGO4Q9HCK5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGO4Q9HCK5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGO4Q9HCK5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGO4Q9HCK5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AGO4Q9HCK5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGO4Q9HCK5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGO4Q9HCK5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGO4Q9HCK5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGO4Q9HCK5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGO4Q9HCK5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms