Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1BQ9H9Y6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1BQ9H9Y6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1BQ9H9Y6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms