Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPS7BQ9H9Q2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS7BQ9H9Q2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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