Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABEP2Q9H5N1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP2Q9H5N1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms