Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MFSD1Q9H3U5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD1Q9H3U5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms