Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNMDQ9H2S6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms