Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASSF4Q9H2L5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF4Q9H2L5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RASSF4Q9H2L5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RASSF4Q9H2L5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms