Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC68Q9H2F9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms