Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MED28Q9H204 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MED28Q9H204 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms