Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM9Q9C026 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM9Q9C026 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms