Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX4Q9BYU1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.6 ms