Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABARAPL3Q9BY60 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 347.9 ms