Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PRXQ9BXM0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRXQ9BXM0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PRXQ9BXM0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms