Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SYCP2Q9BX26 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYCP2Q9BX26 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms