Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT27Q9BW83 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFT27Q9BW83 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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