Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM109Q9BVC6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM109Q9BVC6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms