Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM79Q9BSE2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms