Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIKE1Q9BRV8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms