Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZSWIM1Q9BR11 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZSWIM1Q9BR11 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms