Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS7

HEPH, Hephaestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEPHQ9BQS7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HEPHQ9BQS7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HEPHQ9BQS7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HEPHQ9BQS7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HEPHQ9BQS7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HEPHQ9BQS7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HEPHQ9BQS7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HEPHQ9BQS7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HEPHQ9BQS7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms