Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP9Q99956 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUSP9Q99956 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP9Q99956 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms