Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP4Q99569 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKP4Q99569 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP4Q99569 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms