Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORT1Q99523 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORT1Q99523 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms