Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY1Q96T51 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms