Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
IFT140Q96RY7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
IFT140Q96RY7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms