Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CICQ96RK0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CICQ96RK0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms