Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PANX3Q96QZ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PANX3Q96QZ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms